所谓平行志愿，即指采用平行志愿录取投档，考生在同一位置所选的A、B、C、D等院校之间是平行关系。即改以往的“志愿优先”为“分数优先”，将达到批次录取最低控制分数线的考生，按考生成绩从高分到低分的顺序，由计算机对每个考生所填报的平行志愿，依次检索。
举例而言，假设考生第一志愿里依次填报了A、B、C、D四所平行的院校。录取时，首先考虑将考生档案投到A校。如A校还有计划余额，则投到A校；如A校已经没有计划余额，则考虑考生的B校。若符合B校的投档条件，就不再向C和D校投档，依此类推。在这个过程中，考生不会因为将B校放在了自己志愿填报的第二位置而受到B校的“歧视”，而是和其他在第一位置填报B校的考生一样竞争。按照从A到D的顺序，只要被检索的院校中出现符合投档条件的院校，即向该校投档。档案投出则完成该考生的投档过程，投档后由院校决定录取与否。
如果只是第二志愿属于平行志愿(即小平行或部分平行志愿)，则在第一志愿录取结束后，首先将同一批次线上的“自由可投”的考生按照成绩从高分到低分排序，再按排序先后依次检索每个考生的志愿，一经出现符合投档条件的院校，即向该院校投档。对单个考生而言，根据考生填报的平行志愿中的院校顺序，投档到有计划余额且排序相对在前的院校。
目前，各省市自治区实行的平行志愿方式并不一致，有的省市是在所有批次均实行平行志愿，有的省市则只在某一批次实行平行志愿，有的省市只在每批次的第二志愿实行平行志愿，因此有所谓的“大平行”、“小平行”之说。但无论是哪种平行志愿，其所依据的方法和原则是一致的，考生只需按照平行志愿的规则，结合自身实际填报志愿即可。
相对顺序志愿填报方式而言，平行志愿在一定程度上降低了志愿填报风险，但平行志愿同样存在一定的风险。
其一，按照平行志愿投档的批次，提档比例原则上控制在105%以内，投档人数多于录取人数。如某高校招生计划为100人，提档比例为102%，则被提档的102名考生中，肯定有2人面临退档风险，分数越接近投档线的考生风险越大。（假设学校不增加计划）有的省试行平行志愿100%的投档，还有一些高校承诺提档不退档，这些做法都降低了考生被退档的风险。
其二，由于考生对自身实力估计过高，高考成绩未能达到填报的所有平行志愿高校的投档线，根本不会被投档，录取与否也就无从谈起。
其三，考生虽然达到了学校的投档分，却没有达到所报的专业分，而又不服从专业调剂，那么将会被退档。
其四，各平行志愿高校间没有梯度，投档成功率会下降。
实行平行志愿后，考生投档后被退档的理由，主要是高考总分低、专业不服从调剂、单科成绩不符合要求、体检不合格等。退档后，考生只能参加征集志愿或下一批次录取。
