生物工程专业始建于2000年，2007年被评为沈阳大学实践教学改革示范专业，2012年被评为辽宁省普通高校重点支持专业。本专业建设有发酵工程、食用菌培育和食药检测分析等实习实训基地。培养目标：本专业培养适应现代工业技术领域和社会发展需要，具有生物学、化学、工程学及生物工程专业基础知识；具有良好人文社会科学素养、社会责任感、创新意识和较强的沟通协调能力；具备发酵工艺设计和生物工程工厂设计的能力；具备生物工程领域生产管理、质量监督和项目管理能力；熟练操作生物工程仪器设备，具备食品、药品、生物检测、化验分析能力的应用型工程技术人员。培养方向：主要面向基因工程生化制药、食品酿造行业培养具有生产管理、设备维护、产品质量检验、化验分析和新产品开发及销售、新技术研究能力的应用型工程技术人才。专业前景：生物工程专业发展前景广阔，人类要解决粮食、医疗、保健、能源和环境等重大问题，必须大力开发生物制品，如动植物新品种、生物制药疫苗、工程菌、轻工食品等。毕业生能够在食品、药品行业成长为技术员、工程师和技术骨干。依托沈阳大学生物学和生态学两个一级学科硕士点，本专业可以在生物资源开发与利用、植物抗逆机制研究等领域培养硕士研究生。核心课程：生物化学、微生物学、工程制图及计算机CAD、化工原理、发酵工程、生物分离工程、生物工程设备、基因工程、细胞生物学、食品卫生与检验、生物药物分析、基础药理学等。就业及深造：本专业学生具有较强的生物学、化学和生物工程技术领域的业务技能和相关工作的实践能力。毕业生可以在医药、食品、化学药品、化学试剂、全民健康等企事业单位从事药品、食品和生物制品的检测、化验、产品分析和产品研发工作，很多毕业生已经成为技术骨干。毕业生具有较强的考研能力，考研率占20%左右，考取院校多数为国内知名的双一流院校及中科院科研院所，部分硕士研究生毕业后继续深造考取博士研究生，也有部分学生出国读研深造。

授予学位：工学学士学位。