生物医学工程专业开办于2005年，为一级学科硕士点，是学校重点建设专业之一，以医工结合为特色，拥有省级实验教学示范中心，近年来从海内外引进一批训练有素的优秀骨干教师。学校已启动“广州医科大学－台湾义守大学生物医学工程专业交换生项目”，二年级学生可通过选拔参加该项目，交换学习一学期。本专业实行导师制，培养在医学仪器及电子技术、计算机技术、医学图像处理、生物医学材料等领域具有扎实基础及创新实践能力的高素质人才。

主干学科与主要课程主干学科：电子与计算机技术、基础医学、医学影像技术。主要课程：机械制图、概率统计及应用、工程数学、电工与电路分析、模拟电子技术与应用、数字电子技术、医学图像处理、信号处理与系统、医用传感器、高级编程、医学仪器原理与结构、医疗器械研发管理与注册申报、医疗仪器系统开发与设计、生物医学材料学、生物医学工程导论等。

毕业与学位本科学制四年。颁发生物医学工程专业本科毕业证书，授予工学学士学位。

就业前景培养工科和医学紧密交叉和渗透的高素质应用型人才，能在科研机构、医院、医疗器械公司和相关企事业单位，从事医疗器械、医学影像、医学电子和生物医学材料等技术及产品的研发、管理等工作。