| 年份 | 软科中国最好大学排名 |
| 2024年 | 145 |
| 2023年 | 142 |
| 年份 | 软科医药类排名 |
| 2024年 | 17 |
| 2023年 | 18 |
| 年份 | 武书连中国大学综合实力排名 |
| 2024年 | 179 |
| 2023年 | 171 |
| 年份 | 校友会中国大学排名 |
| 2025年 | 187 |
| 2024年 | 189 |
| 2023年 | 212 |
| 年份 | 校友会医药类排名 |
| 2025年 | 29 |
| 2024年 | 25 |
| 2023年 | 30 |
| 年份 | 金平果本科院校竞争力排名 |
| 2024年 | 256 |
| 2023年 | 265 |
小结： 福建医科大学2025年排名全国第187位，福建医科大学在全国的认可度比较高。
